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30.8: Herramientas y técnicas - Biología

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  • HapMap, un catálogo completo de SNP humanos.
  • PLINK, un conjunto de herramientas C / C ++ GWAS de código abierto que puede analizar grandes conjuntos de datos con cientos de

    miles de marcadores genotipados para que miles de individuos examinen vías potenciales.

  • GRASS (Regresión del conjunto de genes en estudios de asociación), resume la estructura genética de cada gen como eigenSNP y utiliza la regresión de la cresta de grupo para seleccionar eigenSNP representativos para cada gen, evaluando su asociación con el riesgo de enfermedad y reduciendo la alta dimensionalidad de los datos de GWAS.
  • GWAMA (Metanálisis de asociación de todo el genoma), realiza un metanálisis de GWAS de fenotipos dicotómicos o rasgos cuantitativos.


Ver el vídeo: Molecular techniques (Septiembre 2022).